A terapia através das cores fundamenta-se em estudos físico-químicos que comprovam que matéria e energia são manifestações diferentes de uma mesma coisa. A luz é uma onda eletromagnética e como tal apresenta frequências e comprimentos de onda. A energia da luz é proporcional à frequência, ou seja, quanto maior a frequência maior a energia. Heinrich Hertz observou que a luz quando incide em superfícies metálicas provoca a liberação de fótons e elétrons e esse efeito não é proporcional à intensidade da luz, mas à sua frequência. Os fótons são capazes de penetrar na matéria e geralmente transferem sua energia a partículas eletricamente carregadas - as celulas do nosso corpo, por exemplo.

       A incidencia de luz sobre a pele, principalmente sobre pontos de Acupuntura, dependendo da frequência luminosa e do número de fótons envolvidos, aceleram elétrons e aumentam a quantidade de elétrons ativados. Estes devem então produzir os fenômenos biológicos da Cromoterapia.

      Segundo a teoria de Peter Mandel, os receptores da pele reconhecem informações luminosas e as transmitem para o sistema endócrino através de impulsos nervosos. O sistema endócrino é responsável pela produção hormonal do organismo. 

      Para a Colorterapia ou Colorpuntura a doença é uma infomação incorreta na comunicação entre celulas. A terapia das cores é uma das maneiras de equilibrar essa comunicação. 

     Os pontos de acupuntura têm afinidade com as ondas eletromagnéticas principalmente aquelas com frequência na faixa de luz visível que começa no vermelho e vai até o violeta.